在使用CrossCheck（或者说iThenticate）进行SCI英文论文查重时，是否需要查重参考文献通常取决于几个因素，包括你的个人需求、投稿期刊的要求以及查重工具的设置选项，但是一般来说，是需要查重参考文献的，并且带参考文献查重的结果是跟删除参考文献查重的结果差异比较大，以下是详细的说明：
1. CrossCheck的默认查重设置
- 参考文献是否查重：在CrossCheck中文网站查重，默认会提供2份报告，一份包括参考文献的结果，一份排除参考文献的结果，可以根据期刊要求选择对应的其中一份报告，期刊一般是默认查看排除参考文献的报告，但也有极少数部分期刊是需要包括参考文献的结果的，因此同学们根据期刊要求选择。
- 引用部分的识别：CrossCheck和iThenticate的算法通常不会识别出论文的引用部分，我们默认是引用也计算到重复里面，所以尽量减少直接引用。
2. 投稿期刊的要求
不同的期刊在查重过程中可能会有不同的要求，尤其是SCI期刊。以下几点需要考虑：
- 期刊要求参考文献不查重：许多SCI期刊明确表示，查重时会排除参考文献部分，尤其是参考文献的列表，因为这些部分很难体现论文的原创性。
- 期刊要求查重引用内容：有些期刊可能对查重设置更为严格，要求对正文中的引用部分（即引用其他文献的直接段落或语句）进行查重，以确保引用内容不过度复制或抄袭。
3. 查重时需要注意的内容
即使参考文献部分不被查重，仍有几个方面需要特别注意：
- 正文中的引用部分：虽然参考文献列表一般不查重，但你在正文中对他人工作的引用部分，特别是直接引用的句子或段落，可能会被查重系统识别为重复内容。确保引用部分已经按期刊的要求进行规范化处理，并且引用比例不过高是很重要的。
- 过度引用问题：即便引用了合规的参考文献，正文中过多的引用可能仍会导致查重系统报告较高的重复率。因此，确保引用的合理性和论文的原创性非常重要。
4. 查重前的准备
- 检查期刊投稿指南：在使用CrossCheck查重前，仔细阅读目标期刊的投稿指南和查重要求，了解期刊是否要求参考文献部分查重。
- 查重报告的解读：如果查重报告显示较高的重复率，你需要仔细分析报告，确认这些重复部分是否主要来自于引用部分或参考文献。如果是这样，可以根据期刊的具体要求进行调整，或联系期刊编辑说明情况。
对于SCI英文论文的查重，通常需要对参考文献列表进行查重，但是期刊是根据排除参考文献的结果进行判断是否有过度抄袭。期刊在查重时更关注的是正文中的重复内容，特别是是否有不当引用或过度引用的情况。
建议：在投稿前，始终检查目标期刊的具体要求，确保符合他们的查重政策。在CrossCheck中文网查重，如果查重系统没有自动排除参考文献部分（说明原文参考文献格式有问题，需要重新调整），可联系客服帮忙处理，正常可以排除参考文献，但是原文的参考文献自己一定要重新调整，否则后续期刊查重还是排除不了。
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